Praha's gullalder startet da den tysk- romerske keiseren Karl IV (1346- 1378) gjorde Praha til sin hovedstad og har bestemt seg for å gjøre Praha om til Europas mest storslåtte by, som ble økonomisk og som hadde mye kulturelt liv. Mange tyskere flyttet dit etter Karl tok over. Det var først i 1861 at tjsekkerne fikk flertall i byparlamentet. 

På 1600-tallet var Praha sentrum for den bømiske oppstanden som førte til utbrudd av 30 års krigen, som var ett religiøst opprør mot keiseren. Keisern knuste opprørene.

Mange år senere ble Praha okkupert av tyske tropper 15. mars 1939, og Praha var under tysk dømme under nesten hele 2. verdenskrig. Prahas befolkning la opp et væpnet angrep på de tyske troppene og de ble drevet ut.

Senere i 1968 var Praha igjen et sentrum under Praha-våren, da et politisk parti forsøkte en ny politisk kurs under begeistret tilsluttning fra befolkningen, inntil østblokkstyrker og sovjetiske politisk press knuste forsøke samme høst.