Japanese Chrystals gaat over Xiao en Ni Yao, twee Japanse zussen, die net uit Japan naar Barnevoest in Nederland zijn verhuist.
Xiao->
<-Ni Yao
Als ze dan op hun nieuwe school komen, maken ze nieuwe vrienden. Sanne, de nieuwe vriendin van Xiao, heeft een mysterieuze grot gevonden en Ni, Xiao en Sanne gaan daarin kijken. In die grot vinden ze twee kristallen, een blauwe en een rode. Ni Yao legt uit dat hun oma haar uit had gelegd dat het rode kristal voor Xiao was en de blauwe voor Ni.
Nu ze die twee kristallen hebben, zitten ze vol vragen. Wat zijn dit precies voor kristallen? Wat weet hun oma ervan? En wat zijn die mysterieuze krachten? En waar zijn de andere kristallen? Dit moeten ze samen uitzoeken, met hun vrienden.
Dit verhaal gaat niet alleen over de kristallen, Xiao en Ni moeten natuurlijk ook gewoon naar school. Op school maken ze vrienden en vijanden, maken nieuwe vrienden en vriendinnen.
En zo begint het avontuur voor Xiao, Ni en hun vrienden..
